Partnerstvo koje su Microsoft i Novell nedavno obelodanili će biti nekompatibilno sa GPL3 licencom i verovatno je nekompatibilno i sa trenutnom GPL 2 licencom, tvrdi Eben Moglen, profesor prava i open source aktivista. Sekcija 7 trenutne GPL2 zabranjuje ljudima ili korporacijama distribuiranje GPL koda ukoliko su ušli u bilo koji dogovor koji je u suprotnosti sa uslovima licence. Zabrana na primer sprečava Novell da za svoje korisnike naplatu Linux distibucije učini obaveznom ukoliko Microsoft to zahteva kao deo dogovora o patentu. Microsoft i Novell su obelodanili partnerstvo koje se odnosi na Novell-ovu SUSE Linux distibuciju.